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反应位点预测通常被用于在反应机理不明确的体系计算中，比如使用自由基降解水中的抗生素，可以通过研究反应位点为降解路径研究提供一个很好的理论支撑。目前比较常用的预测手段有Fukui分析、静电势分析、分子轨道分析、双描述符分析。对于同一分子应当尽量采用不同的预测方法进行研究相互佐证。
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